劇症型に移行しやすい遺伝子変異を持ったB型肝炎ウイルスを同定する検査。

　B型肝炎ウイルス（HBV）はヘパドナウイルス科に属し、約3,200の塩基対からなる、環状不完全2本鎖DNAウイルスである。そのDNAにはHBs抗原などのenvelopeタンパクをコードするpre-S/S領域、Hbe抗原などの nucleocapsid関連タンパクをコードするprecore-core領域、DNAポリメラーゼをコードするP領域、転写活性を調節する機能をもつX領域の4つのDNA塩基配列転写解読枠（open reading frame：OLF）が存在する。

　HBVには、RNAウイルスにみられるような変異を認める場合がある。すなわちHBVは、増殖時にRNAからDNAへの逆転写プロセスを介するが、この際プレコア領域、コアプロモーター領域などに変異が生ずる。

　このうちプレコア領域では83番目の塩基であるnt1896（nt: base nucleotide）において、G（グアニン）→A（アデニン）への変異がみられ、プレコア領域の28番目のコドンがTGG （Trp）からTAG （stop codon）に変化する。その結果、Hbe抗原前駆体タンパクの翻訳が途中で中断され、e抗原の分泌がストップする。

　一方、コアプロモーター領域では、nt1762の塩基がA→T（チミン）に、nt1764がG→Aとなる変異が知られており、転写因子の結合が阻害されるため、プロモーター活性に影響を受ける。

　つまりプレコア領域の変異はHbe抗原タンパクの翻訳レベルでの障害、コアプロモーター領域の変異は転写レベルでの障害として、Hbe抗原の産生低下に関与している。B型肝炎の重症化や劇症化には、これらの変異と深い関連があるとされる。

　本検査の臨床的意義は、B型肝炎の劇症化と組織障害進行の予測にある。